提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******
近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。
全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。
统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。
相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。
该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。
与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。
该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。
学术支持
中国农业科学院作物科学研究所
记者
宋雅娟
（新春走基层）广西南宁：老少同乐闹元宵******
中新网南宁2月4日电 (黄晓君 黄艳梅)2月3日，临近元宵佳节，广西南宁市邕宁区蒲庙镇红星社区组织居民开展包汤圆、做花灯、猜灯谜、剪窗花和点朱砂等趣味活动，数百人赏花灯、吃汤圆，老少同乐闹元宵。
小朋友在剪窗花。 黄晓君 摄在活动现场，不少家长带着小朋友一起来参加活动。“每年元宵节社区都举办活动，今年我和妈妈一起来的，我做了灯笼，猜了灯谜，还和妈妈一起包了汤圆，特别开心。”家住红星社区的周楚铠小朋友一边向记者展示自己做的红灯笼，一边开心地说。
志愿者为小朋友点朱砂痣。 黄晓君 摄
社区居民一起猜灯谜。 黄晓君 摄在花灯制作的现场，有一位特殊的家长。马保辰是邕宁区蒲庙派出所的民警，这次他和同事到红星社区协办“反诈猜灯谜”活动，现场宣传反诈知识。特别的是，他的儿子和父亲当天也一同来到现场。趁着工作间隙，马保辰坐下陪儿子一起制作灯笼，他说：“儿子玩得非常开心，很难得有机会让我们祖孙三代人一起感受这样浓厚的节日氛围。”
两位老人开心地吃着汤圆，并竖起大拇指。 黄晓君 摄活动现场除了全家出动的家庭组合，还有不少高龄老人的身影，比如74岁的独居老人蔡阿姨。收到社区邀请后，蔡阿姨叫上了两位同龄好友一同来参加活动，三位阿姨坐在一起吃汤圆的画面尤为温馨。
图为活动现场。 杨巧如 摄为了让社区的高龄、独居老人能够度过一个温暖的元宵节，社区工作人员和志愿者还来到部分独居老人家中，为他们送上了热腾腾的汤圆和慰问品，同时为老人进行上门义诊，给他们送去节日的关怀和慰问。
父子俩同时举灯笼，脸上洋溢着幸福的笑容。 黄晓君 摄元宵佳节将至，红星社区不仅组织了丰富多彩的庆祝活动，还通过党建结对、志愿帮扶等形式，与结对单位合作开展现场义诊、反电信诈骗等活动，受到民众欢迎。(完)
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